CLSTF00031     VD

Merge cluster information
Name CLSTF00031
Library ALL 394 cDNA [Download: FASTA]
olea 53 cDNA [Download: FASTA]
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oleb 10 cDNA [Download: FASTA]
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olec 23 cDNA [Download: FASTA]
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olvl 98 cDNA [Download: FASTA]
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olli 21 cDNA [Download: FASTA]
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olbr 4 cDNA [Download: FASTA]
olbr3k12  olbr41j23  olbr49e14  olbr60o15 
olgi 156 cDNA [Download: FASTA]
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olki 4 cDNA [Download: FASTA]
olki17j08  olki34p10  olki35h12  olki56h03 
olsp 10 cDNA [Download: FASTA]
olsp10k03  olsp18m16  olsp21n13  olsp26b11  olsp29j15  olsp30e14  olsp30f15  olsp37g24  olsp52k11  olsp54e08 
olte 8 cDNA [Download: FASTA]
olte14f17  olte29e14  olte33b15  olte3i17  olte41f17  olte45l11  olte49p11  olte56f04 
olova 7 cDNA [Download: FASTA]
olova35d10  olova37p23  olova39b04  olova40m21  olova46e10  olova60e05  olova64f17 

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 2 clones
Length 787
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit apolipoprotein E [Oplegnathus fasciatus]
Score 388
Evalue 3.98745e-38
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
GACGGCTGAAGCTCGACCTCCCAGGTGTGTGACAGAGCTGAAGCAGCACCTCTGACTGCTTGGCT
TACATGCTTTGTATTCGAGTATTACAGTAGATCAAACGATGGAGAAACCATCGTTTTTAATAATT
GTTCTGTTTTTCACAGGTATCTCTCTGCTTAGCAACCATGAAGGCTGTAGCTCTGATCCTTGCCC
TGGCAGTCATCACTGGTGAGTGTTCTCTCTCATTTGCAGCAAACAGGTTAAAAGTTGAACATGGA
GTTTGCTCATCAATGTTCTCATGTTTCCATGACAGGCTGCAATGCCCGTGCTGTGCGCCAGGCCG
AAACCTCCATGACCCGCGTGGAGGACAGCGTGGATCGCTTTTGGCAGTACATCCAAGGGCTGAGC
AAGGATGCTCGTACAATTGTGGACACCCTAACTACCGGAGACATGAGACGAGAGTTGGAGTAAGT
AAACATGATGCCATTTTCTCCTGCTTTTGCATAGTTTGTGTCACTGTTTACTGAACTTATGGTTT
TCTTTTCTTCTAGGACCCTGATCACCGAAACCATGACTGAGGTGACAGAGTACAAAGAGAGTGTC
CTGAGCAAGCTGGGACCCATCACCACAAGCACCAGTGGCCAGATGAATGAAGACCTTAAGCTTCT
GATCAATAAGCTGCAGAAGGACATGACTGATGCTAAGGAGCGCAGTGCTGAATACCTAGGAGAAC
TCAACACCATGGTGACCATGAATACAGATGATGTTCGCAACCGCATCACTGCCTACACCAACAAG
CTGAAGA

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 189 clones
Length 851
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit apolipoprotein E [Oplegnathus fasciatus]
Score 683
Evalue 1.59752e-77
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GATAAAAGCCGTCAGCCACCGATCCGTGAGCACGGCTGAAGCTCGACCTCCCAGGTATCTCTCTG
CTTAGCAACCATGAAGGCTGTAGCTCTGATCCTTGCCCTGGCAGTCATCACTGGCTGCAATGCCC
GTGCTGTGCGCCAGGCCGAAACCTCCATGACCCGCGTGGAGGACAGCGTGGATCGCTTTTGGCAG
TACATCCAAGGGCTGAGCAAGGATGCTCGTACAATTGTGGACACCCTAACTACCGGAGACATGAG
ACGAGAGTTGGAGACCCTGATCACCGAAACCATGACTGAGGTGACAGAGTACAAAGAGAGTGTCC
TGAGCAAGCTGGGACCCATCACCACAAGCACCAGTGGCCAGATGAATGAAGACCTTAAGCTTCTG
ATCAATAAGCTGCAGAAGGACATGACTGATGCTAAGGAGCGCAGTGCTGAATACCTAGGAGAACT
CAACACCATGGTGACCATGAATACAGATGATGTTCGCAACCGCATCACTGCCTACACCAACAAGC
TGAAGAAGCGTCTGACCAAAGACACAGAGGAGATCCGCGAGGCCGTGGCCACCTACATGGGAGAG
GTCCATTCCAGAGCTTCCCAGAACGCAGACTCCGTCAGGGTGCAAGTTGAGCCCTACATCACAGG
AGCTGGTGACGCCGCCAGCAAGAAGCTGACCGACCTCGCTTCAGTCCTTGATGCCCAGGGGTGAC
ACCATCAGGACCCAGCTGGAGAGCAGCATGAGGGAGCTGCGCACCTCCATGGACACCAGGCTGGA
TGAGCTGACCGAGCTGATTGTGCCCCTATGCCACCAAGATCCGCGAGCAGTTTGAGGAGGTCATG
AGCAAG
/medaka