Strains

cDNA/BAC/Fosmid

Plasmid for Knock-in Experiments

Information

Medaka Tools

Medaka Strain
in Publications

References
Lectures of
a conference

Related documents

Biological experiments for elementary, junior high and high school students (Japanese)
Medaka experiments that anyone can do (Japanese)
Life of my teacher Tatsuo AIDA (Japanese)

Featured Link

From spawning to hatching of medaka ~nibb×niconico 
A checklist of the parasites of medaka 
medaka SNP(Beta)
Official Endocrine Disruption Website
M-marker 2009
Ensembl Medaka
M-Base
NBRP Medaka Genome Project
MEPD
Genomicus - Synteny browser -
ZFIN
ZIRC
UTGB Medaka
UCSC In-Silico PCR
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.1 - Vol.3)
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.4 - Vol.11)
Introduction to Medaka (NBRP Online Forum 2020)

CLSTF06807     VD

Merge cluster information
Name CLSTF06807
Library ALL 351 cDNA [Download: FASTA]
olea 0 cDNA
oleb 163 cDNA [Download: FASTA]
oleb10c10  oleb10f17  oleb10g11  oleb10h13  oleb10p12  oleb11a15  oleb11g04  oleb11i17  oleb11n02  oleb12g08  oleb12m06  oleb12n02  oleb14n12  oleb15d07  oleb15i19  oleb15k22  oleb16d24  oleb16l24  oleb17c24  oleb17g20  oleb17j03  oleb17n03  oleb18k17  oleb18l21  oleb19b17  oleb19b23  oleb19d23  oleb19g08  oleb19n04  oleb1f12  oleb20b05  oleb20h03  oleb20h22  oleb20k14  oleb20p06  oleb21f01  oleb21k03  oleb22g05  oleb22h05  oleb22l20  oleb22m08  oleb23e03  oleb23i17  oleb24g18  oleb25g02  oleb25h17  oleb25j05  oleb26l08  oleb26p21  oleb28b24  oleb28k11  oleb28k15  oleb28m18  oleb28p02  oleb29a12  oleb29a13  oleb29c04  oleb29g10  oleb29i01  oleb29i04  oleb29m18  oleb2h02  oleb30f16  oleb32c16  oleb32f13  oleb32f17  oleb32p13  oleb33e19  oleb33n10  oleb34f23  oleb34g09  oleb34l23  oleb34p08  oleb36f06  oleb37d12  oleb37e23  oleb37m17  oleb38l23  oleb38m05  oleb39c09  oleb39f24  oleb39h01  oleb3a01  oleb3a05  oleb3d02  oleb40e12  oleb40i02  oleb40i17  oleb40p18  oleb41d13  oleb41l12  oleb42c06  oleb44h06  oleb45a07  oleb45f24  oleb45g23  oleb45k14  oleb45n13  oleb46n16  oleb47k18  oleb48f22  oleb48l24  oleb49a04  oleb49d24  oleb4e10  oleb50d03  oleb50g17  oleb50l20  oleb50m20  oleb50o11  oleb51a15  oleb51h20  oleb51o04  oleb52m02  oleb53j04  oleb53k16  oleb54c19  oleb54j06  oleb55b05  oleb55m16  oleb55n17  oleb56b10  oleb56h16  oleb56j07  oleb56n11  oleb57c18  oleb57l09  oleb57n14  oleb58g09  oleb59p01  oleb59p24  oleb5c22  oleb5o07  oleb60a05  oleb60b07  oleb60h10  oleb60n09  oleb61d05  oleb61k11  oleb61l05  oleb62c01  oleb62i04  oleb62j04  oleb63c03  oleb63g10  oleb64n14  oleb6l02  oleb6n19  oleb7c19  oleb7d01  oleb7g22  oleb7j08  oleb7l01  oleb7p02  oleb8c21  oleb8g07  oleb8g16  oleb8h13  oleb8k15  oleb8l05  oleb8l11  oleb9e06  oleb9n04 
olec 183 cDNA [Download: FASTA]
olec10b11  olec10b22  olec10d21  olec10j20  olec10l17  olec11g02  olec11i09  olec12l15  olec12p18  olec13d03  olec13l21  olec14d23  olec14h24  olec14l07  olec15l05  olec16i10  olec16i18  olec17p05  olec18b22  olec18d17  olec18e20  olec18g21  olec18i22  olec18j24  olec1d20  olec20f19  olec20k14  olec20p13  olec21j12  olec21l22  olec21p17  olec22i13  olec22k22  olec22p07  olec23b03  olec23g18  olec23l01  olec24a01  olec24i21  olec25a16  olec25g08  olec25g21  olec25h23  olec25m06  olec25m15  olec26b05  olec26c10  olec26f08  olec26i09  olec26i17  olec26p22  olec27b07  olec27j18  olec27o05  olec27o18  olec28b19  olec28b23  olec28c05  olec28d21  olec28e05  olec29a22  olec29b06  olec29m15  olec29m19  olec29o19  olec2g12  olec2o14  olec30d20  olec30e06  olec30h15  olec30k03  olec31g20  olec32f22  olec32g05  olec32p21  olec33k07  olec34d09  olec34m04  olec35i11  olec35j21  olec35l05  olec36k23  olec36p11  olec37c07  olec37j22  olec37k09  olec37l16  olec38g04  olec38g18  olec39d11  olec39n18  olec39p20  olec3l11  olec40a22  olec40b13  olec40c13  olec40f18  olec40h11  olec40k07  olec40m06  olec41d07  olec41e07  olec41e17  olec42d23  olec42i20  olec43a13  olec43c05  olec43g15  olec43j01  olec43n10  olec44f23  olec44h07  olec44i07  olec45j11  olec45k21  olec45p13  olec46h03  olec46h24  olec47c14  olec47g20  olec47i04  olec47n07  olec47p14  olec48h21  olec48i15  olec49b18  olec49d02  olec49i20  olec49j13  olec4e05  olec4i03  olec4k05  olec50e05  olec51c24  olec51e16  olec51f17  olec51n16  olec51n18  olec51o07  olec52b02  olec53g03  olec53i08  olec53k14  olec55e08  olec55p06  olec56b17  olec57f09  olec57f14  olec57k18  olec57p15  olec58f06  olec59g13  olec59i05  olec5g03  olec5h05  olec5k22  olec5o08  olec5p14  olec60l19  olec60o02  olec60p15  olec61c20  olec61f13  olec62e11  olec63b24  olec63k07  olec63m21  olec63o15  olec64h06  olec64l04  olec64l05  olec64n22  olec65c10  olec6g08  olec6p20  olec7h24  olec7l11  olec8a01  olec8g24  olec8h06  olec8j15  olec8o18  olec9e09 
olvl 0 cDNA
olli 0 cDNA
olbr 0 cDNA
olgi 5 cDNA [Download: FASTA]
olgi26n06  olgi27b04  olgi3b15  olgi4d24  olgi65d09 
olki 0 cDNA
olsp 0 cDNA
olte 0 cDNA
olova 0 cDNA

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 6 clones
Length 775
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit muscle-type creatine kinase CKM2 [Oreochromis mossambicus]
Score 800
Evalue 1.96721e-83
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
TGGTGTGGGTGAACGAGGAGGATCACCTGCGCGTCATCTCCATGCAGAAGGGGGGCAACATGAAG
GAGGTCTTCAGACGCTTCTGCGTTGGTCTGCAGAAGATTGAGGAGATCTTCAAGAAGCACAACCA
CGGCTTCATGTGGAACGAGCATCTGGGCTACATCCTGACCTGCCCCTCCAACCTGGGAACTGGCC
TGCGTGGTGGCGTGCACGTCAAGCTGCCCAAGCTCAGCACACACCCCAAGTTTGAGGAGATCCTG
ACCAGGCTGCGCCTGCAGAAGCGCGGCACAGGTGGCGTGGACACCGCCTCTGTGGGTGGAGTCTT
TGACATCTCCAATGCTGACCGTCTGGGCTCCTCTGAGGTGGACCAGGTGCAGCTGGTGGTCGACG
GTGTCAAGCTGATGGTGGAGATGGAGAAGAAGCTGGAAAAGGGAGAGTCCATCGACGGCATGATC
CCCGCCCAGAAGTAGTGGACAACTGAGTGACTTGTCTGTTGTTTTTTTTTTATTTTATAAAGAAA
TGAACATGTAGCCTTGTTGTAAACTTCTTACTGGTTTTGGCTTCTTTCGGTCCAAAGACACTCCA
CCTTTCTTCCCTTTCTAACCTCTAACTTTCCAACTTTCCTCTGATCTCCTTAAATCATCTCCTCT
GTAACATCCTGGGATCAATCGGTGCACAGTCCGGTCGTGGCTATGGAAACGCACCGAAGAAAGAA
AACACTTTCCGTTGTAAAACGCAACTGGACTATTAAACAAAGCCCCATGTAAAAAAAAAA

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 186 clones
Length 1165
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit creatine kinase 1 [Poecilia reticulata]
Score 812
Evalue 0
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GTTCAATGGGGTGACCCCTTCATTGACTTTGACAGGATCTGATCCCGGGACTGTTGCCTCTGTTC
TTGTTTCGTGTGCAGTGTTAGAAAGCAATCATGCCTTTCGGAAACACCCACAACAACTTCAAGCT
CAACTACTCAGTTGACGATGAGTTCCCAGACCTGTCCAAGCACAACAACCACATGGCCAAAGTCC
TGACTAAAGAGCTGTATGGTAAGATGAGGGACAAGCAGACGCCCACTGGATTCACTCTGGATGAC
GTGATCCAGACCGGCATCGACAACCCTGGTCACCCCTTCATCATGACTGTTGGCTGTGTCGCTGG
TGACGAGGAGTCTTATGAGGTCTTCAAAGACCTGCTTGACCCCGTCATCTCTGACCGTCATGGTG
GATATAAGCCCACTGACAAGCACAAGACTGACCTCAACTTCGAGAACTTGAAGGGAGGTGATGAC
CTGGACCCCAACTACGTTTTGTCCAGCCGTGTTCGTACCGGTCGCAGCATCAAGGGATACGCCCT
GCCCCCCCCACAACAGCCGTGGCGAGCGCAGAGCTATTGAGAAGCTGTCCATTGAGGCTCTGTCC
AGCCTTGATGGTGAGTTCAAAGGAAAGTACTATCCCCTGAAGTCAATGACTGATGCTGAGCAGGA
GCAGCTGATCAGTGATCACTTCCTGTTTGACAAACCTGTGTCCCCCCCTGTTGACCTGCGCCGGT
ATGGCCCGTGACTGGCCTGACGGCAGAGGCATTTGGCACAACGACAACAAGACCTTCCTGGTGTG
GGTGAATGAGGAGGATCACCTGCGTGTCATCTCCATGCAGAAGGGTGGCAACATGAGGGAGGTCT
TCAGGCGTTTCTGCGTGGGCTTGCAGAAGATTGAGGAGATCTTCAAGAAGCACAACCACGGCTTC
ATGTGGAATGAGCATCTCGGCTACATTCTGACCTGCCCCTCCAACCTGGGAACTGGTCTGCGTGG
GGGTGTCCACGTCAAGCTGCCCAAGCTGAGCACACACCCCAAGTTTGAGGAGATCCTCACCAGGT
TGCGCCTGCAGAAGCGTGGCACAGGTGGTGTGGACACTGCATCTGTGGGTGGTGTGTTTGACATC
TCCAATGCCGACCGTCTTGGATCCTCCGAGGTGGCGCANGTCCAGTTGGTGGTTGATGGC
/medaka