SNP Pos.

285

513

518

519

522

537

538

539

551

553

554

567

621

637

654

660

678

690

720

730

765

795

819

863

945

1041

1148

Strain number/Species/Symbol Standard sequence

G

T

T

A

C

A

T

C

C

T

T

T

G

C

C

A

C

G

G

C

C

G

T

T

C

C

C

1

k-aaa001

ananassae

AABBg1

A01_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

W

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

T

A01_r

G

Y

C

M

C

G

G

Y

C

R

T

T

C

Y

C

2

k-aa609

ananassae

e pi;bri ru

B01_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

B01_r

T

W

A

S

T

T

A

M

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

3

k-aa611

ananassae

e se; bri ru

C01_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

W

R

N

C

T

T

G

S

N

C

G

N

C01_r

T

G

Y

C

T

N

G

G

T

C

R

C

T

C

C

C

4

non opened stock

ananassae

Om(2C)+ Arc+

D01_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

D01_r

T

W

A

S

T

T

A

M

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

5

k-aa214

ananassae

ca

E01_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

W

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

E01_r

W

T

N

C

T

T

T

G

Y

C

A

C

G

G

Y

N

R

C

T

C

C

C

6

k-aa329

ananassae

px

F01_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

T

N

G

S

C

C

G

N

T

F01_r

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

T

C

G

G

Y

C

R

C

T

C

C

C

7

k-aa607

ananassae

ca;px B5/B6

G01_f

G

G01_r

S

M

Y

8

k-aa307

ananassae

bri pe stw

H01_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

T

N

G

S

C

C

G

N

T

H01_r

T

W

A

S

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

T

C

G

G

C

C

R

C

T

C

C

C

9

k-aa309

ananassae

bri pe stw px

A02_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

T

N

G

S

C

C

G

N

A02_r

T

W

A

S

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

T

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

10

not opened stock

ananassae

Om(2C)8 Arc

B02_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

B02_r

T

T

A

M

T

C

C

G

Y

C

M

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

11

k-aaa020

ananassae

Tonga

C02_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

C02_r

W

T

N

N

N

C

C

G

Y

C

M

N

G

G

Y

N

R

C

T

C

C

C

12

k-aaa226

ananassae

TBU209

D02_f

S

T

N

A

C

A

T

C

N

D02_r

W

13

not opened stock

ananassae

Hawaii-wh

E02_f

S

14

not opened stock

ananassae

L8-2

F02_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

A

N

G

S

W

C

G

N

F02_r

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

A

C

G

G

T

C

R

C

T

C

C

C

15

k-aa802

ananassae

ananassae-y-BR

G02_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

W

R

N

C

T

N

G

S

C

C

G

N

G02_r

W

A

S

T

T

A

M

T

C

T

G

Y

C

T

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

16

k-aa801

ananassae

ananassae-y-IM

H02_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

W

R

N

C

T

N

G

S

C

C

G

N

T

H02_r

T

G

Y

C

T

C

G

G

C

C

R

C

T

C

C

C

17

k-aa111

ananassae

Om(1A)15[E]sn sc rb

A03_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

W

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

A03_r

T

W

A

S

W

T

N

C

T

T

T

G

Y

C

A

C

G

G

C

C

R

C

T

C

C

C

18

k-aa115

ananassae

Om(1D)f[49]Bx[2]w[65]

B03_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

A

N

G

S

T

C

G

N

T

B03_r

T

W

A

S

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

A

C

G

G

T

C

R

C

T

C

C

C

19

k-aa236

ananassae

Pr Om(2F)27

C03_f

G

T

T

A

C

A

T

C

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Y

T

M

R

N

C

A

N

G

S

W

C

G

C03_r

Y

R

C

T

C

C

C

20

k-aa235

ananassae

Pr

D03_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

A

N

G

S

W

C

G

N

D03_r

T

W

A

S

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

A

C

G

G

T

N

R

C

T

C

C

C

21

k-aa217

ananassae

cd cu e

E03_r

Y

22

not opened stock

ananassae

ca Sb Arc

F03_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

F03_r

T

W

A

S

T

T

A

M

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

C

N

R

C

T

C

C

C

23

k-aa703

ananassae

f[83i];e su;bri ru

G03_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

W

R

N

C

T

T

G

S

N

C

G

N

G03_r

T

G

Y

C

T

N

G

G

T

C

R

C

T

C

C

C

24

not opened stock

ananassae

bri pe stw Om(3F)

H03_f

G

T

T

A

C

A

T

C

C

Y

T

C

R

N

C

T

N

G

S

C

C

G

N

H03_r

T

W

A

S

W

T

N

C

T

T

C

G

Y

C

T

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

25

not avaulable

ananassae

L170

A04_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

T

A04_r

G

Y

C

A

S

G

G

Y

N

R

C

T

C

C

C

26

k-aaa222 or k-aaa255

ananassae

N87

B04_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

B04_r

S

G

G

Y

N

R

C

T

C

N

C

29

not opened stock

ananassae

Yonaguni

E04_f

G

T

G

A

C

A

T

C

C

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

E04_r

T

N

A

S

W

T

N

N

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

C

C

R

C

T

C

C

C

30

not opened stock

ananassae

M28F20

F04_f

G

T

T

A

C

T

T

A

N

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

T

F04_r

T

W

A

S

T

T

A

M

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

31

k-aaa100

ananassae

VAV150

G04_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

T

T

G04_r

W

T

N

N

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

C

C

R

T

T

C

C

C

B06_r

W

T

N

C

T

C

T

G

Y

T

A

C

G

A

C

C

R

C

T

C

C

C

35

k-aae002

pallidosa

NAN24

C05_f

G

T

G

A

C

A

T

C

C

Y

C

C

A

T

C

A

N

A

S

C

C

G

N

C05_r

T

N

A

S

W

T

N

N

T

C

C

A

T

C

A

C

N

G

C

C

R

C

T

C

C

C

36

k-aae006

pallidosa

TBU155

D05_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

C

R

N

C

A

N

G

S

C

C

G

N

D05_r

T

N

N

A

W

T

N

C

T

C

C

G

Y

C

A

C

G

G

N

C

R

C

T

C

C

C

37

k-aa803

pallidosa

pallidosa-IM

E05_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

C

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C

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G

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T

N

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T

N

N

T

C

C

A

T

C

A

C

N

G

C

C

N

C

T

C

T

C

38

k-aa804

pallidosa

pallidosa--BR

F05_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

C

A

T

C

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N

A

S

C

C

G

N

F05_r

T

N

N

A

W

T

N

N

N

C

C

A

T

C

A

C

N

G

N

C

R

C

T

C

T

C

39

k-aau001?

pallidosa-like

LAE345-IM

G05_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

W

G05_r

N

R

C

T

C

C

C

42

not available

pallidosa-like-WAU

WAU61

B06_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

W

R

N

T

A

N

G

N

C

C

G

N

43

k-aav001

pallidosa-like-WAU

WAU92

C06_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

W

R

N

C

A

N

G

N

C

C

G

N

C06_r

W

T

N

C

T

C

T

G

Y

C

A

C

G

A

C

C

R

C

T

C

C

C

44

k-aat003

papuensis-like

WAU142

D06_f

G

C

T

A

C

A

A

C

C

Y

C

W

R

N

C

A

N

G

N

C

C

G

N

D06_r

C

W

A

S

A

A

N

C

T

C

T

G

Y

C

A

C

G

A

N

C

R

C

T

C

C

C

45

k-aat007

papuensis-like

LAE360

E06_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

Y

C

W

R

N

C

A

N

G

N

C

C

G

T

E06_r

T

N

N

A

W

T

N

C

T

C

T

G

Y

C

A

C

G

A

N

C

R

T

T

C

C

C

46

k-aat002

papuensis-like

AUS51

F06_f

G

T

C

G

A

A

T

C

C

C

C

W

R

N

C

A

N

G

S

C

C

T

N

F06_r

W

T

N

C

C

C

T

G

Y

C

A

C

G

G

C

C

N

C

T

C

C

C

50

k-aac001

monieri

B07_f

G

B07_r

S

G

A

Y

Y

A

C

T

C

C

C