BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000464|15440
(15,440 letters)
Database: NAE000464.fasta
1 sequences; 15,440 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000464|15440|same 3.061e+04 0.0
>NAE000464|15440|same
Length = 15440
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 15301 tgcaaaacccagtgccgctgccgtggtgcctgccataccgccagcgcagatcttaaagaa 15360
Query: 15361 ctgccttctgctgacctgcatggattgctccttgtttcgacattgtcacgtcccatttac 15420
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Sbjct: 15361 ctgccttctgctgacctgcatggattgctccttgtttcgacattgtcacgtcccatttac 15420
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Query: 3517 ctggaatcctggg 3529
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Sbjct: 853 ctggaatcctggg 841
Database: NAE000464.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 15,440
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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length of query: 15,440
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effective search space used: 237961476
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