BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000407|10601
(10,601 letters)
Database: NAE000407.fasta
1 sequences; 10,602 total letters
Searching.done
Score E
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NAE000407|10602|diff 2.100e+04 0.0
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Sbjct: 10381 gtcgatttgtccttcagacagctcactgatcttaacatcttcagcgatacccgctgcagc 10440
Query: 10440 caggatggctttagaacgggtcttgccgacgccataaatcgaagttaatgcgattacggc 10499
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Sbjct: 10441 caggatggctttagaacgggtcttgccgacgccataaatcgaagttaatgcgattacggc 10500
Query: 10500 atgcttatgatcaggaatgttaatgcctgctatacgggccactatgcactcctactattt 10559
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Query: 10076 gatggtgttgtt 10087
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Sbjct: 152 gatggtgttgtt 141
Database: NAE000407.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,602
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 78
Number of Sequences: 1
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Number of successful extensions: 30
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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length of database: 10,602
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effective length of database: 10,588
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effective search space used: 112095156
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