BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000340|15169
(15,169 letters)
Database: NAE000340.fasta
1 sequences; 15,169 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000340|15169|same 3.007e+04 0.0
>NAE000340|15169|same
Length = 15169
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Minus
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Strand = Plus / Minus
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|||||||||||||
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|||||||||||||
Sbjct: 1951 taaagctgatcac 1939
Score = 26.3 bits (13), Expect = 2.9
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Query: 1939 gtgatcagcttta 1951
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Sbjct: 799 gtgatcagcttta 787
Database: NAE000340.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 15,169
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 192
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Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
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length of query: 15,169
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effective search space used: 229674025
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