BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000330|10892
(10,892 letters)
Database: NAE000330.fasta
1 sequences; 10,892 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000330|10892|same 2.159e+04 0.0
>NAE000330|10892|same
Length = 10892
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Identities = 10892/10892 (100%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 672 tttgatatcaaa 683
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Sbjct: 683 tttgatatcaaa 672
Database: NAE000330.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
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Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 90
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Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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effective length of query: 10,878
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effective search space used: 118330884
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