BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000257|10914
(10,914 letters)
Database: NAE000257.fasta
1 sequences; 10,914 total letters
Searching.done
Score E
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NAE000257|10914|same 2.164e+04 0.0
>NAE000257|10914|same
Length = 10914
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 10381 attaccacaccatcgacaccctgattcagtaacagtgaaaaccgctgtgccagctgctca 10440
Query: 10441 ccgtctttaccgccgtgaagcaaaaaaaccatccgtccctgcgcttccagagcttccgtc 10500
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Sbjct: 10441 ccgtctttaccgccgtgaagcaaaaaaaccatccgtccctgcgcttccagagcttccgtc 10500
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Sbjct: 10741 tttttggcggtagccatgcagatgacctactccctgattatgtgacagataaaacgtttt 10800
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Query: 1630 cagttgcaactg 1641
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Sbjct: 1641 cagttgcaactg 1630
Database: NAE000257.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,914
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 88
Number of Sequences: 1
Number of extensions: 88
Number of successful extensions: 28
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 18
length of query: 10,914
length of database: 10,914
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effective length of query: 10,900
effective length of database: 10,900
effective search space: 118810000
effective search space used: 118810000
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