BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000182|10958
(10,958 letters)
Database: NAE000182.fasta
1 sequences; 10,958 total letters
Searching.done
Score E
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NAE000182|10958|same 2.172e+04 0.0
>NAE000182|10958|same
Length = 10958
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 10201 ccagcgtgccgcggcggaaccaggcgctgccaatactggcggaggcgtcaatgccggaat 10260
Query: 10261 cattgcgcggctgcttgctgatcatattgatcgagcctgtcggtgcgctgcgcccgtagt 10320
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Sbjct: 10261 cattgcgcggctgcttgctgatcatattgatcgagcctgtcggtgcgctgcgcccgtagt 10320
Query: 10321 cggtgccggacggccctttaatcacttcgacctgctcggtattgaaggtgtcgcgcgaga 10380
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Query: 10381 cgctgccgatatcgcgaatgccatcaatataaatactgttagaggtatcggcaccacgca 10440
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Query: 10441 tataaatggcgtcgccagtggtggagttaccgttctcacccgcaaaaaacgcacccacgc 10500
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Sbjct: 10441 tataaatggcgtcgccagtggtggagttaccgttctcacccgcaaaaaacgcacccacgc 10500
Query: 10501 cggggacgtttttgagcgcgtcggtaaggttggttgcgccctgatctttaatcacttgtt 10560
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Sbjct: 10501 cggggacgtttttgagcgcgtcggtaaggttggttgcgccctgatctttaatcacttgtt 10560
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Query: 10741 cggcaaagaacgtgagcgaatgaaattgtctggcagggaaattgcgattgttttccattt 10800
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Sbjct: 10801 tgcaggtgactttttcttatatgttgaaattttcactgccacgagaaagcctctctgcgg 10860
Query: 10861 atgcgatgccactgttaatcccgtgatagtgctcgtgaaagtgataataattttgataag 10920
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Query: 10921 cattatcacttggagcgattttctatcacccattgcgc 10958
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Sbjct: 10921 cattatcacttggagcgattttctatcacccattgcgc 10958
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Strand = Plus / Minus
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Query: 6894 tgccggatgcggcgtaaacgccttatccgtcctac 6928
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Query: 10444 aaatggcgtcgccagt 10459
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Sbjct: 5087 aaatggcgtcgccagt 5072
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Query: 1571 cttatcaggcctac 1584
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Sbjct: 6865 cttatcaggcctac 6852
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Query: 1626 cggataaggcgtttacgc 1643
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Sbjct: 6833 cggatcaggcgtttacgc 6816
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Query: 6816 gcgtaaacgcctgatccg 6833
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Sbjct: 1643 gcgtaaacgccttatccg 1626
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Query: 6852 gtaggcctgataag 6865
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Sbjct: 1584 gtaggcctgataag 1571
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Query: 3085 gccatcacctgcc 3097
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Query: 7119 ggttccgccgcg 7130
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Query: 10210 cgcggcggaacc 10221
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Query: 9015 ttttcgatatca 9026
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Query: 5887 tcaggtcgcggc 5898
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Sbjct: 262 tcaggtcgcggc 251
Database: NAE000182.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,958
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
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