BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000163|10731
(10,731 letters)
Database: NAE000163.fasta
1 sequences; 10,731 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000163|10731|same 2.127e+04 0.0
>NAE000163|10731|same
Length = 10731
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Strand = Plus / Plus
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Query: 10321 gccgcatcggggcgggcagcaagagggcgtgttacttgaaaagctaaaagctggtgaagt 10380
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Sbjct: 10321 gccgcatcggggcgggcagcaagagggcgtgttacttgaaaagctaaaagctggtgaagt 10380
Query: 10381 tagcgccgaaggtctgcgcattgtgctggaagcgggtattcgcgagccgatgatcatgcg 10440
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Sbjct: 10381 tagcgccgaaggtctgcgcattgtgctggaagcgggtattcgcgagccgatgatcatgcg 10440
Query: 10441 ggccaatcaggcgctgtatgcgcaattacaccccataaaagaatccattttctggcgtca 10500
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Sbjct: 10441 ggccaatcaggcgctgtatgcgcaattacaccccataaaagaatccattttctggcgtca 10500
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Sbjct: 10561 cctctggcaaccacttttccatgacaggagttgaatatggcattcagtaatcccttcgat 10620
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Sbjct: 10621 gatccgcagggagcgttttacatattgcgcaatgcgcaggggcaattcagtctgtggccg 10680
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Sbjct: 10681 caacaatgcgtcttaccggcaggctgggacattgtgtgtcagccgcagtca 10731
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Query: 6824 ggcaagattttt 6835
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Sbjct: 2433 ggcaagattttt 2422
Database: NAE000163.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,731
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 93
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Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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length of query: 10,731
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effective length of query: 10,717
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effective search space used: 114854089
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