ファイトミクサ綱 (ネコブカビ, Sorosphaera, Phagomyxa など)
アコンクリニダ目
レティキュロシダ目
グオミア綱 (Gromia)
アセトスポラ綱 (ハプロスポラ類) (Haplospoidium, Urosporidium, Minchinia など)
クロララクニオン藻綱 (Chlorarachnion, Bigelowiella, Lotharella など)
メトロモナス目 (Metromonas）
メトピオン目 (Metopion)
ロイコディクティオン目 (Massisteria、Leucodictyon など)
リムノフィラ目 (Limnofila)
メソフィラ科 (Mesofila)
ナノフィラ科 (Nanofila)
デスモソラカ目 (Clathrulina, Hediocystis など)
ファエオダリア綱 (Aulosphaera, Coelodendrum など)
ケルコモナス目 (Cercomoans, Eocercomonas, Paracercomonas)
パンソモナス目 (Cercobodo, Aurigamonas)
グリッソモナス目 (Heteromita, Bodomorpha, Proleptomonas, Allantion など)
Sainouron
Helkesimastix
Rigidomastixs
スポンゴモナス綱 (Spongomonas)
Pseudopirsonia
エブリア目 (Ebria など)
テコフィロセア綱 (Cryothecomonas, Protaspis grandis, Lecythium, Pseudodiffulgia)
タウマトモナス目 (Thaumatomonas, Thaumatomastix, Gyromitus, Allas など)
ユーグリファ目 (Euglypha, Cyphoderia, Paulinella, Ovulinata など)