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Strain - 詳細 -

分譲依頼
株番号 NIES-1333
保存機関名 国立環境研究所
門名 Haptophyta 綱名 Prymnesiophyceae
目名 科名
学名   Chrysochromulina sp.
シノニム
一般名 ハプト藻
地名(採集年月) 日本    東京湾 (2003-10-16)
採集者名  
生息環境(分離源) 海域
生息環境の詳細   
分離者名(分離年月) 岡本典子
同定者名 岡本典子
株の状態 非無菌; 単藻; 非クローン
保存形態 継代培養
凍結保存 不明
培養条件(前培養条件) 培地名:ESM
培地形状:液体
温度:20 ℃
光強度:4-5 μmol phtons/m2/sec  明暗周期:10L:14D
継代培養周期:1 M
遺伝子情報 18S rRNA (DQ980478 ) 28S rRNA (DQ980468 ) 28S rRNA (DQ980469 ) actin (DQ980438 ) actin (DQ980417 ) actin (DQ980418 ) alpha-tubulin (DQ980533 ) alpha-tubulin (DQ980487 ) alpha-tubulin (DQ980488 ) alpha-tubulin (DQ980532 ) beta-tubulin (DQ980514 ) beta-tubulin (AB194979 ) beta-tubulin (DQ980513 ) beta-tubulin (DQ980519 ) beta-tubulin (DQ980520 ) EFL (AB377267 ) Hsp90 (DQ980442 ) Hsp90 (DQ980444 ) Hsp90 (ABJ80934 ) Hsp90 (DQ980443 ) Mitochondria DNA (AB930144 ) rbcL (AB510942 )
画像
Chrysochromulina sp. 1333
特性
    ゲノム解読株 (Nishimura et al. 2014); 原生動物(NIES-1334, NIES-1335) の餌に使用
細胞サイズ(min-max) 5μm   体制 単細胞性; 鞭毛性  
注意事項  

文献
Okamoto, N., Inouye, I.: 2005: The katablepharids are a distant sister group of the Cryptophyta: a proposal for Katablepharidophyta divisio nova/Kathablepharida phylum novum based on SSU rDNA and beta-tubulin phylogeny.: Protist, 156, 163-179.
Strains: 1333 1334 1335

Kim, E., Simpson, A. G., Graham, L. E.: 2006: Evolutionary relationships of apusomonads inferred from taxon-rich analyses of nuclear encoded genes.: Mol. Biol. Evol., 23, 2455-2466.
Strains: 936 955 1333 1335

Nishimura, Y., Kamikawa, R., Hashimoto, T., Inagaki, Y.: 2012: Separate origins of group I introns in two mitochondrial genes of the katablepharid Leucocryptos marina.: PLoS One, 7, e37307 (article ID).
Strains: 1333 1335

Nishimura, Y., Kamikawa, R., Hashimoto, T., Inagaki, Y.: 2014: An intronic open reading frame was released from one of group II introns in the mitochondrial genome of the haptophyte Chrysochromulina sp. NIES-1333.: Mobile Genetic Elements, 4, e29384 (article ID).
Strains: 1333

Edvardsen, B., Eikrem, W., Throndsen, J., Sáez, A. G., Probert, I., Medlin, L. K.: 2011: Ribosomal DNA phylogenies and a morphological revision provide the basis for a revised taxonomy of the Prymnesiales (Haptophyta).: Eur. J. Phycol., 46, 202-228.
Strains: 1333 1393