cDNA ( Data source : RAP-DB )
cDNA Detail
jump to Other species ESTs data to homologous Rice cDNA
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General information
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RAP - Accession No.
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AK069875
Link to RAP-DB
(
IRGSP 1.0
)
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RAP ID
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Os11g0499600
(
IRGSP 1.0
)
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RAP - Chromosome No.
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11
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RAP - Location, Length
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19,930,872 -
19,938,120
( + )
;
7,249(bp)
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Exon (Data source : RAP-DB)
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Exon 1
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Location |
19,930,872 -
19,931,306
( + )
;
435 (bp)
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Exon 2
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Location |
19,934,606 -
19,934,798
( + )
;
193 (bp)
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Exon 3
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Location |
19,935,777 -
19,935,862
( + )
;
86 (bp)
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Exon 4
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Location |
19,936,387 -
19,936,518
( + )
;
132 (bp)
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Exon 5
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Location |
19,937,194 -
19,937,358
( + )
;
165 (bp)
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Exon 6
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Location |
19,937,661 -
19,938,120
( + )
;
460 (bp)
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Chromosome: 11
, position: 19,930,872
- 19,938,120
bp
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Now loading
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Sequence (Data source : RAP-DB)
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Nucleotide
Fasta Format
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000001 attctcctca ctatttggtg cagcgacccc cacccaccca tcaattcctt cttccttcgt
000061 ctcctcctct tctccctgca cactcgttgc tagctagctc acccataaat accacgccat
000121 tggccacctc caatctccaa gctagttctc actcacacat ccctctcctc cctccgccgc
000181 cgccgccgcc ggagctaagg aagacgacga cgcataggta gataatcgtc ggcggccatg
000241 gctaaggagg cgttcgtgaa cgggttcctg agcgtgttca tgcacgtggg gctaacgctg
000301 gtgctgctcg tctacctccc catcgccttc gcctgccgcg ccctgggcag gctgctcgtc
000361 aggcccttcg tctccggcga ggacctccgc ggcaaggtcg tgctcgtcac cggcgcctcc
000421 tccggcatcg gcgaggtacg tacgtagcca gcacagctga gcattgcaac tcattgtgtc
000481 ctgcgccatc tgacttactt tcctctaacg tgtgtgtggg tcactgacat atgagctctt
000541 tagatagcga gctcgaactc acatgtcagt gatttataaa gtcatggggt gtgtttagtt
000601 cacgccaaaa ttgaaagttt gattgaaatt agaatgatgt gacggaaaag ttagaagatt
000661 atgtgtgtaa aaagttttga tgtgatggaa aagttagaag tttgaagaaa aattttggaa
000721 ctaaacaagg gctatatggt gggttaagtt agaggatgtt agtgatttgg attctttttt
000781 ttctagctgt gtttgctgca tatatacaac ttttttttta ttatattagt tcttgattta
000841 attagatact actacatggt ttataatgtt cagagtttat tttgttcgtg ctgggttttc
000901 ttgaattttt tttctaaaaa aatgatattg aatggtggtt tgaaataatg gaaatgaatg
000961 cattctaaca tatgtactcc tgatcacgaa tagaaatagg acagaattaa aagacacaag
001021 gatatacatg gctctcgtga tttttaatgg gttcagtgca gtggctttta ttcattggta
001081 cgatttggtg ctattaaaga cacaaccatg catatgagca aagctgaaaa gcagaacctg
001141 tggatttgca tggttgcagg agtatatatc ttaattttgc atctgtgtcg actgtgacat
001201 ggagtacgca ccaaggctag ctagcacaaa gttgacgtgg tagtaaaaaa atcaactaaa
001261 atttcacgtt ggaacttaat ttggtctttg ttgttgcaac gacttctgcc aatatggttg
001321 caattagatt tgacaagttt gatttaatta gttctgataa atgtttggtg acgatgataa
001381 tttaatttat ttctatgcta ctaaataata tttgagatga taggtagaag tttatggacc
001441 tcaatatata agtataagta gcatagataa tttgtgtgtt ccagaaaaaa aagtaaaaag
001501 aaaatgaagt cggtacagtg ggtaagagcc aactcatgac aatttctctt tcctatagtt
001561 ttatataatt aatatctatc tttcagttgt actgttcata taaatatata cagcttttat
001621 ttcctatggt ttctctgtaa ttaatatata tagctttcca aaaagaaaaa taacatatcc
001681 ggacttcaac tgtagctgat gatcatatca atgccaactc cagggtcctt gactatttct
001741 ctctaaaaaa tattatttat tggaccattt tatatattaa agaaatataa aaccatttta
001801 tgaccgcacc accattggac cgaaacaagc atttatatgc ataaaagcga aatatctaca
001861 gcagcaagca tgggcgcgat acttcgtcta gaactagagc gtgtgtgcat ttaatctggt
001921 tggtataatt aattgaaatt agtcgaccgt atatatacat gaatctaaca gtacaccgcg
001981 cgccaaaaag gcattcatcg tcgaaatatc aaatgatgca tgtggtgaca aaatcaaatc
002041 atcaactagg aggaaccgtt agtcccccag atacatttct gtggtagcta gattagtgag
002101 ttgttgatat aatttaatta acaagttaat ttggtcaaag ttacctttaa gggatgggtc
002161 ccacaaatga tttcttttgt tcggtaatag catttatttt gcaattcata cttaacatag
002221 ttttcagttt aagtaaaccc atgaaatatc atatcattct tttttaattc tgaaccatat
002281 tatctgtagt gctaagcgct aacatggaag tgttggagca ctgtagttaa gacatgttta
002341 tctaagagca aaactaataa tacagccgac ttgttagcta taaggttctt tgcagccttc
002401 gtcagctatt tacaattaat acaggtccac ttatctctct cacataattt tttttggttc
002461 atgtgtttcc ctcttctctc ctcagtctaa gtatttagcc aacttactgt gtcctattac
002521 acctgctctt aagcagagta tttaagctat agtcagatta ctctgattcc tagtaggcac
002581 agaagcaata aatacaatcc gggaatccca ttaatttgga gcatggcctc tctcatcgac
002641 ctctcctgga aacttgcttg gccataattc tagatatctg taggagtagc agataggcag
002701 ccatggctgc ccccagtccc cagatgcatg tgatgataca gtcacgggag ttaaagatca
002761 ttcatggcct gagagagatg agaggtcgtc tatactacta gtgatgaaat catcagtgaa
002821 cccccatcaa tgatggccta tctactcgtc ctattttccc ttgaattctc ccattaattc
002881 tttgacgtga acgtaagata cactgtgaag acgaagggca cgtacatgta cagccttgtc
002941 aggacaagcc aagaaagtga gcactgtgtc ctctctatcg tgtgcagaag tacacagcga
003001 aataagattt agcacttgtt tagttccaaa ctttttcttt aaacttctaa ttttttcatt
003061 acatcaaaac ttttttacac atatagactt ctaacttttc catcacatcg ttctaatttc
003121 aaccaaacta acttttaatt ttggtgtgaa ctaaacacac ccttatcgtc tcatgatttt
003181 cgatcgtgtt tgtgtgtcct tgcttggaga agtccagaaa cgtcgtgaat cacacacgtt
003241 tattaatttt tgggagttaa gagagaaaaa ggatcgaatt aataaggacg actgacccca
003301 agaaatgata catatgcacg taacttgtac atgcgctaat tatgcaacgc tgacaacggt
003361 taaatcatta acaaaaatcc atctggaaaa tcataagttg acaactcgtt tcagtcgaat
003421 taacaacaat cagtcagttc aaactaatta aattgcttca aattaaaatt ttcctctttt
003481 catgtaaaaa ttatactctt gttacacaga gcaagctagt ctacctttgg tttcatttgt
003541 ttgacagaac cagtttaatt aatttcctca caaatagtag tacggagtaa ctatgagttt
003601 ttgtttatta agtttaatta atttcttcac aaatagtagt gcactgtgtt tttgtttatt
003661 aagttttttg tgtttgtcct ggatgaaaat taataaaata aaataaacat ggtatatatg
003721 tttttttttt gcagcatcta gtgtacgagt acgcgaagaa gggggcgtgc gtggcgctga
003781 cggcgaggac ggagatcgcc ctgcgcgcag tggcgaagac ggcgcgcgac ctcggcgcgc
003841 cggacgtgct cgtcgtgccg gcggacatca ccaaggtcga cgacgccaag cgcgccgtcg
003901 aggagaccgt cgcccacttc ggcaaatgtc agttaactcg atcagtacaa ctcctactcc
003961 tataccgctt aattaataag aagtatttta cgttccttaa gatgagatac taattaaatt
004021 ttacacttaa ttcttaatat acttattatc tatagatagc aaattttata ctaggggccc
004081 gttcactttg atgccatttt caaccatacc atttttttaa agttataaaa aaatatctac
004141 gtttagttgt tgccaaactt gataaatacg taaaaaatcc tgccaaaatt ttgacaaaaa
004201 tagatcctgg gaaataggat acttctatgt atattctctc aagaataata aaattactcc
004261 aatctggagg attaatatgt ccaaccatca acttgaccga acaagttatt aattgctctg
004321 tttcaaaatt tgaggtattc aattttactg ctgatagtat agcgacgttg attttgtttc
004381 gagtgatatg atggttcaga ccgagggctt ggggcgacgt tgtcctgcca acgacagctt
004441 gatctgctta tggacagaaa ttgattatgc gtatatggct gtgtcgttct cccaagtccc
004501 aagtggctaa ttaattaaga cctaatcttt taggatcctg aatgtctagt agctgagagg
004561 atggaatggt tcaagtcatg gacttatcac ttatggaaga agatattaag gctaatactg
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004801 tctcggaagt agctgaactg catgcagtga tctacagcga tagatgattt aagttagtta
004861 ttgtcatgtg tactaattaa ttatggggta aattcaattc tgcagtgaat cacctggtgg
004921 ccaacgcagg gatctggtcc agttgcttct tcgaagaaat taccaacata accgccttcc
004981 acaacgtgat tgtgagttga ttaattatca cacgctagct ccttttgaca ttttcaacat
005041 ttttgccacc cccagcagtt ctcattatca ccattaaaat cttagtttaa acattagcac
005101 atctgaaatt tttgagtgag tcgtttcctc ttgttcacac acaaaaaaaa aacatactat
005161 atgaaaatca ttttcctcac agctgaccat ggtcccttat attatatcat ttatttggtc
005221 caacgacgta cccaccagta ataaaatcag tggtctccca gagcttggat ttcaaaagga
005281 gaccagattt tatagcagtg tttagttcag cgtaaagttt ggattttggt taaaattaga
005341 gatgatgtga ctgaaaagtt gtgtgtgtat gaaaggttga tgtgatggaa aaggactgaa
005401 gtttggatcc aaactttgga tctaaacaca gcctagttgt ggttaaccat cgatcagttg
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005581 tggcaacatc gtcgtcacct cctctgtcgc cggcagggtc ccgacggcca ggatgagctt
005641 ctacaacgta agcagcttaa ttagcagaga ctaattaaat taattactta ttactagtga
005701 tactaattgc atgattaagt aattgatcca tgcctctgtg gcaattaaag tagtagtact
005761 actcctactc aggttgtagc aataagtttc gatcagctca cctaaccaat tcaattaggt
005821 gcaccaatac cccaactata gcccggggtg atggattatg cgtatggttg gatatctgcc
005881 aaagctaaac tcacacatta gtgagagagg tccatctcac aaagtatatg atagcttagc
005941 ttagctagca agccaggatc tagctgatag ctagcaataa ccccctgtta tggttcactg
006001 attatcctac atgtgtcacg cccaatagtg gcggcaagta gcaggggctc attgactact
006061 cattccatgt tggttcacta tatgtatagt tcacatgtat agtactatgc atggattgca
006121 acattccctg tagttctagc atcacactca tctcattaat taatcagttt ttgtccctac
006181 atttgatcac caattggaca cagatcaaga aaaaattttg ggttggcgcg tggtccatag
006241 tactaatatc gtatgtgctt aaaaaaatat tcttaaaaaa aaattgtacg cttgatgctt
006301 ataactatta ttattattac aggcgagtaa gggcgcggtg atcaggttct acgaaaccct
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006421 caacctcacc atgggcaaag gcatccagaa ggacggccat gtcggcattg acgaggaggc
006481 tcgcgacgta agatctcgat cgattatata tatacttgat ttttagttgt acgtatgatg
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007141 tatatatata taaacttttt ttatacatga tgatatcatg atcttttgat aatgatgatt
007201 ggtttgtttt agcataagaa atacttcagt taaagaggat tgggagatg
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Notice:The following homologous wheat ESTs and barley ESTs are BLAST results with E-values less than e-20.